Kino-lab blog

2016年1月13日水曜日

[火曜討論会2016] Nature Podcast(2015/7/16) Brain drain

担当：佐藤
参加者：８名

論文要約：
外傷性脳損傷(IBT)は慢性外傷性脳症やアルツハイマー病の環境リスク要因として最もよく知られ、疾患の特徴はリン酸化タウタンパク質の蓄積を主病変とするタウオパチーである。今回我々はTBI後の疾患の早期ドライバーとなるシス型リン酸化タウを発見し、対応する治療法を提案する。
http://www.nature.com/nature/journal/v523/n7561/full/nature14658.html

議論点：脳への衝撃に関して定量的な基準を定めることはできるか

知りたいこと「Aの量の衝撃でBの量のシス型リン酸化タウが増える」
これがわかれば定量化できそう。

Aの量の測り方：
　・TBIを発症するのに必要な衝撃を基準にする
　・外部で原因となったエネルギー量を用いる
　・経験歴の長さを用いる
　・頭の加速度を測定する
　　　⇒ヘルメットやヘッドバンドに加速度計を取り付ける
　　　⇒頭の内部にだけ影響のあるような衝撃を測れない？
　・脳内部の血流を測る
　　　⇒侵襲型で大変そう
　・頭蓋骨の骨伝導とかから図る方法
　Aについてはなんとか図れそう

Bの量の測り方：
　・PET
　　　⇒大掛かりな機械が必要で気軽には測れない
　どのタイミングで測るかなど、大変

まとめ：
脳への衝撃はなんとかして図れそうであるので、問題なのはシス型リン酸化タウの測定
スポーツ選手など、TBIのリスクがある人などを対象に研究が行われたりしないだろうか
命に関わる疾患なので「あなたの脳への衝撃は危険域にありますよ」というような診断が出せるような枠組みができたら良さそう

2016年1月12日火曜日

[火曜討論会2015] 大学生物の教科書　第一章　細胞:生命の機能単位(B4 田河）

担当：田河
参加者：9名

概要：

生命体は高分子がただ単に集合するだけではなく、それらが区画化されていなければならない→細胞
細胞には真核細胞と原核細胞が存在しており、それぞれの細胞には様々な機能を持った小器官が存在している(例:細胞壁、細胞質、核、リボソーム、ゴルジ装置、葉緑体)
真核生物の進化の過程として、細胞内共生説が存在する

議題：人工的に細胞を作りだすには

■今何が出来ないのか

全く別の素材から細胞を作る
人工的に細胞内共生？

■逆にいまできること

人口細胞膜
進化する細胞→細胞の複製昨日が向上した例あり

■細胞に必要な要素とは

膜がある
自己複製可能　　　　　　　
生命活動を恒常的に維持

　→　上２つは既に実現されているが、分裂しつつ人間に組み込める機能を持った細胞はまだ作られていない

■ゲノム編集では難しいが人工的に細胞が作れたらできること

オールマイティな細胞（万能がん治療細胞とか）
外部因子によって機能が変化する細胞

まとめ：
既に人工細胞はある程度作られてはいるが、未だに人間に埋め込むことでメリットをもたらすようなものは開発されていない。今後人工的な細胞が作られるとしたら、ゲノム編集等の他の技術では実現することが難しい機能変化や万能細胞的な用途で用いられそうである。

2015年12月31日木曜日

[火曜討論会2015] Nature Podcast(2015/7/9) Banishing HIV

担当：安澤
参加者：10人

概要

HIVのような（少なくとも小スケールでは）対策が確立された病気が、未だに猛威をふるっているのは何故だろうか。一つ言えるのは、実験環境で仮定する理想的な環境は、現実には当てはまらないということである。科学者は実地での適応についてより考えるべきではなかろうか。

―― Nature Podcast: Banishing HIV (Text)

Feature: How to beat HIV

議論点

人類にとって最も脅威となりうるウイルスの特徴

○脅威度は何で決まるか

感染力

強ければ空気感染で広がる

致死率

高すぎると逆に広まらない（エボラ出血熱等）

治療の難度

ウィルスの多様性（変異しやすさ）

潜伏（検出の難しさ）

○間接的に影響を与える

ウィルスの媒介生物
ヒトの生活に関わる生物に感染するウィルス

栽培植物など多様性が低いと単一の疾患にやられる可能性も

○対策

検出→隔離→治療・予防

ゲノムを読む→検出・感染経路の特定

接触をできるだけ避ける

非接触型の医療技術

在宅治療
遠隔手術

完治したか（感染の恐れがないか）の検出法の確立

まとめ

家にいながら検査や治療ができれば、接触を減らすことができ感染症対策にもかなり有利なのではないだろうか。今後の発展に期待。

2015年12月8日火曜日

Nature podcast(2015/6/11) Antarctic biodiversity

担当：池野

参加者：10名

元論文：

The changing form of Antarctic biodiversity

Steven L. Chown , Andrew Clarke, Ceridwen I. Fraser , S. Craig Cary , Katherine L. Moon1 & Melodie A. McGeoch1

http://www.nature.com/nature/journal/v522/n7557/abs/nature14505.html

概要：

南極や南大洋の生態系は考えられていたよりずっと多様である。多様性に大きく影響する要因として、エネルギー獲得や長期間にわたるレフュジアが考えられている。人間の活動や全球的な気候の変化は南極の生態系の理解を妨げてしまっているため、国際的な協定によって南極の一部地域を保護する動きも進んでいる。

論題：

多様性を保てる環境保護の基準

■多様性とは？

・生物種の多さ

　・どれくらい離れた種が共生しているか

・種間のバランスが取れている

・生き方の違いの多さ

■多様性の違う環境の例

多様性大きい：熱帯林

多様性小さい：極地、砂漠

■人間の利益と保護のトレードオフ

・人間の利益＞保護の例

　・森林破壊、温暖化、埋立地、乱獲、外来種

■環境保護の案

・絶滅しそうな生物種の保護

　・生態系のバランス崩壊の可能性は残ったまま

・現状維持するよう手を加える

　・人間の与えた影響に対して

　・それ以外の与えた影響に対して

　　・そもそも、人間が影響を把握しきれていない

・人間が全く関与しない

　・人間の利益は無し

まとめ：

一概に基準を定めることは難しく、個々の環境にあわせた基準が必要とされる

影響を人間が把握しきれておらず、影響ベースでの基準の策定が難しい。

2015年12月3日木曜日

2015 ラボ合宿 @山形県東根温泉

11/21、22にかけて行われたラボ合宿です。
今年は、御茶ノ水女子大学の由良研究室と合同で行いました。
行き先は山形県のさくらんぼ東根温泉です！！

今回はレンタカーでの移動としました。
途中で48号線沿いにある、ニッカ宮城峡蒸留所に寄り道〜♪

大きな蒸留釜

ニッカのウイスキーがずらり

その後、天童市内の水車そばに移動してお昼ごはん。

名物の鳥中華

そして旅館に移動。
旅館は、「よし田川別館」です。

最初に木下先生のお話から始まり、発表会をしました。
時間が限られていましたが、楽しい発表会になったと思います。

豪華な晩御飯(この後まだまだお料理が…)

晩御飯の後は、部屋に集まってボードゲームをしたり雑談をしたりと、遊んでおりました。

二日目は、朝ごはんをいただいたのち、ホテルを後にして、山形県の様々な場所に観光に出かけました。

あさごはん

霞城公園では、石垣の修復をしていました

春には桜がきれいだそうです

高畠ワイナリー

様々なところを観光して、とても楽しい二日目でした。
高畠ワイナリーで由良研のみなさんとはお別れして、寄り道をしながらゆっくりと仙台に帰りました。

合宿を合同でやるのは、研究室始まって以来初めてのことでしたが、なんとか無事に終えることができてよかったです。

来年はどこに行くのかな？

加賀谷

2015年12月2日水曜日

Nature Podcast(2015/6/11) Bronze Age genomes

担当：小舘
参加者：10名

音源：
http://www.nature.com/nature/podcast/index-2015-06-11.html

元論文：
Population genomics of Bronze Age Eurasia
Morten E. Allentoft et al.
Nature 522, 167–172 (11 June 2015) doi:10.1038/nature14507
Received 14 February 2015 Accepted 01 May 2015 Published online 10 June 2015
http://dx.doi.org/10.1038/nature14507

概要：
ユーラシア各地の古代人101人のゲノム解析。青銅器時代には、現在のアジア及びヨーロッパの人口構造形成の原因となる大規模な集団移動があった。印欧語族拡散の仮説と一致。また淡色皮膚は既に高頻度で存在したが、ラクトース耐性は稀だった。

議題：
民族間で違いがでるもの、他の哺乳類と違うもの

●乳糖耐性
大人では本来必要なくなるため、耐性を持たない（５歳ころまで）
しかし：ヨーロッパ人は大人でも耐性を持ち続ける

・SNP頻度：日本0%, アフリカ0%
→ヨーロッパ起源でそこでのみ広まった？

・[牛, ヤギ]乳と生存　←進化圧？
　↓
・乳製品の起源：
　- 飲料としての乳：B.C. 9000頃　中東
　- 最古のチーズ：B.C. 5500頃　ポーランド
　（脂質のみで乳糖は関係ナシ、ただし酪農文化は重要かも）
　- 乳を飲む文化：エジプトから

・これまでの研究：B.C. 5500頃耐性獲得
　今回の研究：青銅器時代（B.C. 3000-1000）でも稀
→急速に拡散？

・飲めなくなるのは容易（どこかが壊れれば良い）
　飲めるようになる変異はレア？

●まとめ
　乳糖耐性ひとつ取っても分からないことが多く、謎が深まった。