参加者:7名
節の概要
8-4,8-5 DNAの解析と操作 遺伝子の発現と機能の解析
議論点
遺伝子機能特定方法の今後
ーーーーー現在ーーーーー
□現在の目標…全細胞、全条件での網羅的調査
全細胞 → できそう(全細胞のDNAメチル化解析)
全条件 → 条件が何かまだわからない場合すらある
(全てのノックアウト組合せの解析、
現実的にはある程度予測して2ペアくらいでやる)
□現在の手法
○ノックアウト(遺伝子から形質を探す) ・・・現在の主流
L 発現量測定(DNAマイクロアレイ)
L 過剰発現(量を減らしてダメなら増やそうという考え)
○スクリーニング(形質から遺伝子を探す)
L タンパク質のスクリーニング
L 変異体のスクリーニング(GWAS)
○個々のタンパク質機能の解析(現在まだよくわかっていない)
□現在の問題点
・ ノックアウトしただけでは形質に変異が出現しない場合がある
→ある特定条件下において起こる可能性がある=条件特異性
→全遺伝子のモデル化まで到達していない
→様々な条件(環境因子等)も含んだモデルの作成
↓
□問題への対処
書かれていない要因(実験環境のデータなど)をどうデータ化する手段が必要
考え得る手段は
・ データから要因を推定する(難しそう)
・ 自分たちで条件を記録しながら再実験
(全ての条件を記録するわけにはいかない、ある程度絞る必要性)
実例として、稲の栽培における環境データを集めた研究がある
このような研究は手間(時間とお金)がかかる
→今はまだマニアックな部類
↓
未来の遺伝子機能特定方法の開発の糸口に?
ーーーーー未来ーーーーー
全タンパク質のシミュレーションが可能となり、より精密なモデル作成ができるように...
遺伝子機能特定方法の今後
ーーーーー現在ーーーーー
□現在の目標…全細胞、全条件での網羅的調査
全細胞 → できそう(全細胞のDNAメチル化解析)
全条件 → 条件が何かまだわからない場合すらある
(全てのノックアウト組合せの解析、
現実的にはある程度予測して2ペアくらいでやる)
□現在の手法
○ノックアウト(遺伝子から形質を探す) ・・・現在の主流
L 発現量測定(DNAマイクロアレイ)
L 過剰発現(量を減らしてダメなら増やそうという考え)
○スクリーニング(形質から遺伝子を探す)
L タンパク質のスクリーニング
L 変異体のスクリーニング(GWAS)
○個々のタンパク質機能の解析(現在まだよくわかっていない)
□現在の問題点
・ ノックアウトしただけでは形質に変異が出現しない場合がある
→ある特定条件下において起こる可能性がある=条件特異性
→全遺伝子のモデル化まで到達していない
→様々な条件(環境因子等)も含んだモデルの作成
↓
□問題への対処
書かれていない要因(実験環境のデータなど)をどうデータ化する手段が必要
考え得る手段は
・ データから要因を推定する(難しそう)
・ 自分たちで条件を記録しながら再実験
(全ての条件を記録するわけにはいかない、ある程度絞る必要性)
実例として、稲の栽培における環境データを集めた研究がある
このような研究は手間(時間とお金)がかかる
→今はまだマニアックな部類
↓
未来の遺伝子機能特定方法の開発の糸口に?
ーーーーー未来ーーーーー
全タンパク質のシミュレーションが可能となり、より精密なモデル作成ができるように...
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